El área natural protegida más importante es el Parque Nacional Los Cardones. Se encuentra en el Centro-Norte de Salta, abarcando un gradiente ambiental que va desde la unidades altoandina y puneña en las partes más altas hasta la prepuna y el monte en los sectores bajos.

Otros sitios de interés de la prepuna son algunos de los más importantes yacimientos arqueológicos de Salta y Jujuy. También se encuentra un área de reserva con cardonales: la Reserva Provincial Valle Fértil, en San Juan.